常見病中傳染病危害最大，傳染病通常由病毒感染所致，其流行和發生一般需要通過傳染源、傳播途徑和易感鴨群三個環節。因此，掌握鴨病發生特點，控制傳播環節，做好防疫治療，方可保證養鴨效益。
鴨瘟
本病僅限于雁行目禽類，如鴨、鵝、天鵝等。鴨群突然出現持續存在的高死亡率，鴨精神不振，食欲減退，體溫升高到42℃，翅膀下垂、伏地不起；病鴨頭頸部腫大；喙、腳和黏膜呈藍色；下痢，排綠色或灰白色稀糞；泄殖腔黏膜充血、出血、水腫或外翻，并覆蓋綠色假膜，剝離后留有瘍面。鴨全身皮膚、黏膜、漿膜、內臟器官有血斑點；皮下組織水腫；部分鴨頭頸部腫大；口腔黏膜有黃色壞死性假膜覆蓋，用刀刮去假膜，可見到黏膜出血淺，潰瘍食管黏膜表面覆有黃色或草黃色假膜，呈小斑塊狀或條索狀；泄殖腔嚴重充血、黏膜表面覆有棕黃色或綠褐色的壞死痂塊，不易剝離。
防治加強鴨舍環境的衛生控制，注意定期進行消毒。應按照免疫流程進行疫苗接種，禁止從非免疫區購入雛鴨或種鴨。如發現有患病鴨，立即對全群進行隔離，緊急接種鴨瘟弱毒疫苗，肌肉注射1羽份，1天后可以產生免疫力。早期治療可用氨芐西林鈉200克，鹽酸環丙沙星100克，配合黃芪多糖提純原藥100克，加水混合飲用，之前控水1～2小時，1次飲完，連用3～5天。
病毒性肝炎
本病發生于5～10日齡雛鴨，成鴨不發病，初次發病鴨在2～10天死亡率達90%，10～18日齡死亡率達40%，18～28日齡死亡率達20%以上，28天以后死亡率很低。患病鴨跟不上群，停止運動，蹲伏并半閉眼，呆滯，厭食，身體側臥，兩腿痙攣性后踢，頭向后背部后仰，出現癥狀后1小時左右死亡。剖檢病死鴨可見肝臟腫大、質脆，有點狀或淤斑狀出血，顏色不一，日齡小的呈土黃色，日齡大的呈灰紅色，色淡，表面斑駁。
防治種鴨在產蛋前2～4星期接種鴨免疫弱毒疫苗，間隔6星期后再免疫1次。初生雛鴨用弱毒疫苗免疫，肌肉注射或足蹼皮內刺種。也可給雛鴨注射血清或卵黃抗體。對發病鴨群及時免疫注射血清、卵黃抗體，患病早期鴨用利巴韋林100克加水200公斤飲用，用前控水1～2小時，或用黃芪多糖提純原藥100克加鹽酸環丙沙星100克混合后加水250公斤，讓鴨飲用，每天2次，連用3天。
傳染性漿膜炎
本病又稱鴨疫里氏桿菌病，是侵害雛鴨的一種急性敗血性傳染病，其發病率和死亡率都非常高，是危害養鴨業的重要傳染病。本病一年四季均可發生，春冬季節較為多發，1～8周齡的雛鴨易感本病，但種用鴨極少發生。如果飼養環境條件不好可誘發本病，如育雛期飼養密度過大，室內潮濕、通風不良，飼料中缺乏維生素、微量元素等，特別容易引起本病的流行。本病主要由呼吸道或皮膚傷口感染，被病鴨污染的空氣等途徑傳播。病鴨神態倦怠，運動失調，頭頸震顫，昏睡。眼、鼻有分泌物流出，輕度咳嗽或打噴嚏，排淡綠色糞便。心包膜、肝臟表面有纖維素性滲出物。嚴重的病鴨有神經癥狀，頭頸向身體右側彎轉90度，呈S型。
防治1～2周齡雛鴨使用氧氟沙星飲水，50克氧氟沙星加水200公斤，每天1次。如果鴨群已患病可使用頭孢安泰（主要成分為硫酸丁胺卡那、頭孢噻肟鈉、腸道修復因子）100克加水300公斤給其飲用，每天1～2次，連用3天；漿膜凈（主要成分為氨芐西林鈉、鹽酸環丙沙星）100克加水100公斤給鴨飲用，每天2次，連用3～5天；腸力素（硫酸黃連素、頭孢哌胴鈉）100克加水250公斤給鴨飲用，飲前控水，每天2次，連用3天。同時可用四黃提純原藥（主要成分為黃芪、黃連、黃柏、大黃）拌入飼料，從而促進藥物的快速吸收，提高機體抗病力及免疫機能。
流感
本病主要是由A型流感病毒感染，鴨發病率和死亡率取決于病毒毒類、日齡、環境和繼發感染等，比較常見的是高發病率。鴨為流感病毒的主要儲毒宿主，強毒可使其直接發病，弱毒可在體內反復傳代增殖變異為強毒。雛鴨急性死亡，眼結膜潮紅、流淚、流鼻液、喙紫黑色，個別出現腫頭和共濟失調的神經癥狀。成年鴨的產蛋率急劇下降，受精率和孵化率也顯著降低；眼結膜炎、潮紅，胰腺有出血點或壞死點，心肌多數有條紋狀壞死。肝臟有出血點，脾臟腫大有灰白色壞死點，母鴨有卵黃性腹膜炎癥狀，腺胃與肌胃交界處有出血點、腺胃乳頭出血。病鴨常會繼發或混感大腸桿菌病。
防治強化飼養環境是預防本病的主要措施，可用當地分離毒株制備的滅活疫苗對鴨進行免疫接種。對早期患病的鴨用當地分離株制備的高免血清或高免蛋黃液進行治療。使用鹽酸恩諾沙星100克與氨芐西林鈉100克和板藍根提純原藥100克混合后加水200公斤，讓鴨飲用，每天2次，連用3天。
番鴨細小病毒病
本病自然感染的只有番鴨，多發生于3周齡以內的雛番鴨，尤以10日齡左右雛番鴨發病最多，發病率為27%～60%，病死率為20%～50%。本病呈地方性流行，成年番鴨感染后不發病，但排毒。病鴨排白色或綠色水樣稀糞，喘氣、軟腳，有時出現扭頸等神經癥狀。剖檢后可見小腸腸腔膨脹硬實，內有臘腸樣的栓子。十二指腸前段有多量膽汁，整個小腸呈卡他炎癥，黏膜表面有大量出血點，或有黏膜脫落，或有炎性滲出物，有時腸黏膜上附著散纖維素性凝塊，呈黃綠或暗綠色。
防治應加強鴨舍環境控制，在種蛋孵化時嚴格進行消毒，并注意孵化室的衛生消毒。在番鴨1～3日齡時皮下或肌肉注射番鴨細小病毒高免血清或蛋黃液，成年鴨開產后每3～6個月皮下或肌肉注射番鴨細小病毒弱毒疫苗。患病早期的鴨群用高免血清或高免蛋黃液進行治療，也可用鹽酸環丙沙星100克、林可霉素100克、鹽酸嗎啉胍100克混合后加水200公斤，讓鴨飲用，每天2次，連用5天。
大腸桿菌病
本病各季節都有發病，各種年齡鴨均可感染，以雛鴨和小鴨的敗血型和產蛋母鴨的卵黃性腹膜炎危害最為嚴重。本病可單獨發生，也常與鴨傳染性漿膜炎、鴨病毒性肝炎等感染和繼發感染。各種惡劣的環境條件和應激因素都能促使本病的發生和流行。
病鴨精神沉郁，食欲下降基至廢食，排黃白色稀糞。剖檢病死鴨可見纖維素性心包炎、肝周炎、氣囊炎、腹膜炎。心包上纖維素性膠膜不易剝離，而鴨傳染性漿膜炎則易剝離。母鴨腹部膨大，排白色帶有蛋白碎片的糞便，剖檢可見腹腔內充滿蛋黃碎片或干酪樣物。
防治加強鴨舍環境衛生控制，飼養用具要經常消毒，還要注意檢查水源是否被大腸桿菌污染，如有污染要及時更換。注意鴨舍育雛期的保溫及飼養密度，保持舍內通風良好，糞便要及時清除，以減少氨氣污染。平時可使用抗生素類藥物進行預防，盡力防止寄生蟲等病的發生。如果有鴨群發病，要及時隔病鴨，可用當地分離菌株制備的滅活菌苗對未發病鴨進行免疫。